Du tilldelar samma name="deletetask"
för varje kryssruta. Så när du skickar in ditt formulär får du bara senast valda deletetask
värde. Så, ditt misstag är här
<input class="checkbox" name="deletetask" value=
Borde vara
<input class="checkbox" name="deletetask[]" value=
Så du måste byta namn på deletetask
till deletetask[]
så dina kryssrutor skickas som en array och gör sedan något liknande
$todelete = $_POST['deletetask'];
//or $_GET, if you are submitting form through get. But I would recommend you using POST
$stmt = $pdo->prepare("DELETE FROM table WHERE id = ?");
foreach ($todelete as $id)
$stmt->execute($id);