Jag tror att dina frågor i stort sett besvarades i den föregående frågan du hänvisade till.
1) När du skapar tabellen. InnoDB ger fler fördelar än bara låsning på radnivå. Bättre hastighet när du har flera sql-klienter som gör uppdateringar, mindre risk för dataförlust/korruption, referensintegritet etc... Med bara ett fåtal transaktioner per sekund (TPS) kommer du sannolikt inte att se skillnaden i prestanda, men InnoDB är mer pålitlig och skalar bättre.
2) Med endast 2-3 TPS kommer du inte att se någon signifikant skillnad mellan InnoDB och MyISAM. Även på halvgammal hårdvara.
FYI, en modern hårddisk bör kunna hantera minst ~200 uppdateringstransaktioner per sekund.
Jag rekommenderar att du läser på InnoDB , MVCC och ACID .