Navicat kan göra det åt dig. Det kommer också att synkronisera schema och/eller data mellan två mysql-databasinstanser. Jag har använt det med framgång tidigare.
http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql/mysql_overview .html
Det finns en skärmdump av verktyget för data- och struktursynkronisering här:
http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql /mysql_detail_mac.html#7