Jag misstänker att du blandar ihop innobackupex med något som mysqldump . Den förra säkerhetskopierar de faktiska tabellfilerna, medan den senare ansluter till databasservern och hämtar data.
Eftersom det försöker säkerhetskopiera databasfilerna det kommer naturligtvis att behöva tillgång till filsystemet på databasservern och kan inte fjärrköras.
Det du kan göra är att strömma innehållet i säkerhetskopian till en fjärrmaskin :
innobackupex --stream=tar ./ | ssh example@sqldat.com "cat - > /data/backups/backup.tar"
Eller spara bara den resulterande säkerhetskopian på en annan server med den metod du väljer (t.ex. delad enhet, scp , rsync )