Förutsatt att varje ID visas i båda tabellerna (helst bara en gång):
update tmpList inner join table1 using (id) inner join table2 using (id)
set table1.ts = tmpList.ts_value, table2.ts=tmpList.ts_value;
Uppdatering:att helt enkelt använda left joins istället för inner joins gör att detta fungerar även för ID som bara finns i en tabell - den otillämpliga set-satsen verkar bara ha hoppats över; Jag borde tydligen ha provat det tidigare.