Efter mycket sökande kunde jag fixa problemet "PID-filen kan inte hittas" på min maskin. Jag använder OS X 10.9.3 och installerade mysql via Homebrew.
Först hittade jag min PID-fil här:
/usr/local/var/mysql/{username}.pid
Därefter hittade jag min my.cnf-fil här:
/usr/local/Cellar/mysql/5.6.19/my.cnf
Slutligen lade jag till den här raden längst ner på my.cnf:
pid-file = /usr/local/var/mysql/{username}.pid
Förhoppningsvis fungerar detta för någon annan och sparar dig huvudvärk! Glöm inte att ersätta {username} med din maskins namn (jeffs-air-2 i mitt fall).