Gå till Redigera -> Inställningar -> SQL Editor och där ser du:
DBMS connection keep-alive interval (in seconds): 600
DBMS connection read time out (in seconds): 600
DBMS connection time out (in seconds): 60
Keep-alive-intervallet för DBMS-anslutningen betyder hur ofta Workbench skickar keep-alive-förfrågan till servern för att hålla anslutningen vid liv.
Eftersom 5 minuter ==300 sekunder, ställ in DBMS-anslutningsintervallet för att hålla vid liv <300 (t.ex. 250)
Det kommer att betyda "skicka keep-alive-förfrågan var 250:e sekund". Klicka på OK.
Avsluta sedan MySQL Workbench och starta om den så att ändringarna träder i kraft.
Om du använder standard TCP/IP över SSH anslutningsmetod kan det också vara bra att konfigurera ssh ServerAliveInterval också.