Det kanske använder en standard PHP-konfiguration. Jag har funnit tidigare att den inte använder samma php.ini eller inte använder en alls. Därför kommer vissa av tilläggen inte att aktiveras.
Gör så här istället:
php -c /etc/php.ini /path/to/script.php
Där /etc/php.ini är sökvägen till din ini-fil. Du kan hitta detta genom att göra en phpinfo();