Du måste förmodligen ändra det för både klienten (du kör för att göra importen) OCH demonen mysqld som körs och accepterar importen.
För klienten kan du ange det på kommandoraden:
mysql --max_allowed_packet=100M -u root -p database < dump.sql
Du kan också ändra filen my.cnf eller my.ini (finns vanligtvis i /etc/mysql/) under mysqld-sektionen och ställ in:
max_allowed_packet=100M
eller så kan du köra dessa kommandon i en MySQL-konsol ansluten till samma server:
set global net_buffer_length=1000000;
set global max_allowed_packet=1000000000;
(Använd ett mycket stort värde för paketstorleken.)