mysql uppdatera kolumn med värde från en annan tabell

Utöver detta svar om du behöver ändra tabellB.värde enligt tabellA.värde dynamiskt kan du till exempel göra:

UPDATE tableB
INNER JOIN tableA ON tableB.name = tableA.name
SET tableB.value = IF(tableA.value > 0, tableA.value, tableB.value)
WHERE tableA.name = 'Joe'