Använder gnu awk
(på grund av RS)
awk '{$1=$1} NR%2==1 {printf "%s,",$0} NR%2==0' RS="[,\n]" file
XXXXXXXXXX,YYYYYYYYYY
TTTTTTTTTTT,UUUUUUUUUU
RRRRRRRRR,JJJJJJJJJ
111111111111,22222222222
333333333333,44444444
5555555,666666
EEEEEEEE,WWWWWW
QQQQQQQ,PPPPPPPP
{$1=$1}
Rensar upp och tar bort extra mellanslagNR%2==1 {printf "%s,",$0}
skriver ut udda delarNR%2==0
skriver ut jämn del och ny radRS="[,\n]"
ställer in posten till ,
eller nylinje