TSQL - Hur använder man GO inuti ett BEGIN .. END-block?

Jag hade samma problem och lyckades till slut lösa det med SET NOEXEC .

IF not whatever
BEGIN
    SET NOEXEC ON; 
END

ALTER TABLE dbo.EMPLOYEE ADD COLUMN EMP_IS_ADMIN BIT NOT NULL
GO
UPDATE dbo.EMPLOYEE SET EMP_IS_ADMIN = whatever

SET NOEXEC OFF;