Din fråga i PHP-koden ger inte det önskade resultatet eftersom du har ställt in Position och Secondary till samma värde. Baserat på exempeldatan du angav kommer det inte att returnera något.
Om du letar efter en fråga för att välja kvalificerade spelare för dropdwon kan du ändra frågan så att den ser ut så här:
SELECT * FROM `allsquads`
WHERE `Team` = '$t1select'
AND (`Position` = '$position[$i]' OR `Secondary` = '$position[$i]')