problemet är här
const app = require("../index.js"); // the express server
Varje gång du försöker kräva index.js tekniskt sett kopierar du in all kod från index.js till ditt testskript.
Eftersom du kör flera testfiler samtidigt, försöker varje test köra samma kod inuti index.js
Du kan läsa mer om denna http://fredkschott. com/post/2014/06/require-and-the-module-system/