Det visar sig att att placera den nedladdade mongodb-databasen i den synkroniserade mappen mellan värddatorn och den virtuella maskinen orsakade någon typ av behörighetsproblem eller konfigurationsproblem.
När du tar ut den ur den synkroniserade mappen - som med största sannolikhet har Vagrantfilen - och lägger den i en mapp som inte är synkroniserad/delad verkar det fungera bra. Tänkte rädda någon de 5 timmarna jag slösat bort :-)