Naturligtvis är det möjligt, men du måste hitta ett sätt att tvinga in flexibiliteten hos ett dokument-db som MongoDB till ett RDBMS som SQL Server.
Det betyder att du måste definiera hur du vill hantera saknade fält (kommer det att vara en NULL i kolumnen db? eller ett standardvärde?) och annat som vanligtvis inte passar bra i en relationsdatabas.
Said gör, du kan använda ett ETL-verktyg som kan ansluta till båda databaserna, SSIS kan vara ett exempel om du vill stanna i MicroSoft-världen (du kan kolla detta Importera MongoDB-data med SSIS 2012 för att ha en idé) eller så kan du välja ett verktyg med öppen källkod som Talend Big Data Integration a> som har en koppling till MongoDB (och givetvis till SQL Server).