Du kan använda $where :
db.myCollection.find( { $where: "this.a1.a != this.a2.a" } )
Var dock medveten om att detta inte kommer att gå särskilt snabbt, eftersom det kommer att behöva snurra upp Javascript-motorn och upprepa varje dokument och kontrollera villkoren för varje.
Om du behöver göra den här frågan för stora samlingar, eller väldigt ofta, är det bäst att införa en denormaliserad flagga, som areEqual . Ändå ger sådana lågselektiva fält inte bra indexprestanda, eftersom kandidatuppsättningen fortfarande är stor.