Lösning:
För de som stötte på samma problem - här är vad jag hittade. Jag körde show variables like 'datadir' och fick reda på att mina datafiler är lagrade i en annan mapp:C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 5.5\data\
och jag ersatte filer i mappen C:\Program Files... initialt. Det fanns också de nödvändiga filerna närvarande.
Så till slut gick allt bra.