Jag har inte MySQL på den här maskinen att testa men jag tror
SELECT myCol
FROM myTable
WHERE myCol REGEXP '^[0-9][0-9][A-Z]$'
Borde göra det. ^ är ett ankare för start av sträng, $ för slutet av strängen och resten bör vara självförklarande.
Det verkar som att du också kan använda REGEXP '^[[:digit:]][[:digit:]][[:alpha:]]$' men helt oprövad och går bara bort från dokumenten.