När du kör från kommandotolken efter att ha kompilerat din klass använd detta
java -classpath .;mysql-connector-java-5.0.8-bin.jar Version
Håll både jar och java-filen i samma katalog och försök. använda sig av ";" istället för ":" som nämnts ovan. inkludera paketnamn om något. Jag har testat att det fungerar.