Om jag förstår din fråga rätt, för att svara på delen för att bara returnera en riktning, försök med frågan nedan:
SELECT d1.*
FROM train_schedule d1
INNER JOIN train_schedule d2 ON d2.train_no=d1.train_no
WHERE d1.stn_code = 'JU' and d2.stn_code = 'JP'
AND d1.distance < d2.distance
JU (avgång) kommer alltid att ha avstånd mindre än JP (ankomst).