Ändra bara teckenuppsättningen för hela databasen:
ALTER DATABASE databasename CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_unicode_ci;
Och självklart kan du göra det för något bord.
Mer mer, ta en titt på dokumentationen här.
EDIT:
Annars, om dina data redan är skrivna i "?" märker, är verkligheten att den är skadad.