Jag tror inte att ditt md5-ied user_id skickas till uppdateringsfrågan eftersom det inte finns någon md5()-funktion som gör uppgiften i top if condition och du måste också vara säker på att hur värdet lagras i databasen, är det md5- ied user_id eller normal user_id ? om för md5 user_id prova så här,
if(isset($_GET['user'])){
$id = $_GET['user'];
$id = md5($id);
$sql = "UPDATE request SET email_verification=1 WHERE Id='$id'";
$result = $conn->query($sql);
if ($result === TRUE) {
header('Location: index.php');
}
else {
echo "Error updating record: " . $conn->error;
}
}