Avgränsaren används endast av mysql-klienten (inte på API, drivrutin ... etc).
Så det kommer inte att fungera.
Se ditt felmeddelande :-
[sql] Executing resource: /mysql/install/db_auto_increment_settings_procedure.sql
[sql] Failed to execute: DELIMITER
Ganska säker på att detta kommer att fungera i linux-systemet
mysql -u root -pxxx -h yyy < YOUR_SQL.sql
Om det är tillämpligt skapar du bara den lagrade proceduren manuellt med mysql-klienten,
och är en lösning utan att svettas.
Om du behöver skapa detta dynamiskt
kan det här dokumentet ge lite insiktsinformation
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/connector-j-usagenotes-basic.html