Många, många saker kan orsaka det här felet . Enligt min erfarenhet är det vanligtvis en SQL-fil på över 1MB, eller, wait_timeout på dina servrar my.cnf är satt mycket lågt (sextio sekunder) måste justeras korrekt. När du distribuerar my.cnf, prova en wait_timeout 86400 och ett max_allowed_packet med "nog" för att importera den filen.
Till exempel:
[mysqld]
wait_timeout = 86400
max_allowed_packet = 1GB
PS. Jag skulle inte rekommendera så här höga parametrar i faktisk produktion.