Teoretiskt sett ja. Praktiskt taget måste du först skaffa (eller skapa dig själv) klass härledd från System.Data.Entity.Migrations.Sql.MigrationSqlGenerator
som kommer att ansvara för att generera SQL för MySQL. Här
handlar mer om att anpassa (eller skriva om) SQL-generering.
Du kan också vänta tills utvecklare av EF-stödjande ADO.NET-leverantörer inkluderar denna funktion i sina paket. Till exempel Devart har redan börjat arbeta med deras migreringsstöd för deras Oracle, MySQL, PostgreSQL och SQLite.