Du utför förmodligen ajax-förfrågningar, detta är ett vanligt problem...
Jag skulle föreslå att du använder sessionsdatabasen och gör ajax-samtal för att inte uppdatera sessionen...
Gör detta på din sessionsklass
class MY_Session extends CI_Session {
public function sess_update()
{
$CI =& get_instance();
if ( ! $CI->input->is_ajax_request())
{
parent::sess_update();
}
}
}