Följande kommando fungerade för mig på Windows:
C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\bin>mysql_upgrade.exe -u root -p --force
Om root-lösenordet inte är inställt kan du behöva göra detta innan du kör kommandot ovan:
mysql> STÄLL IN LÖSENORD FÖR 'root'@'localhost' =LÖSENORD('något');