Testade MySQLWorkbench och insåg att jag glömde lägga till --default-character-set=utf8 under kommandoraden. Försökte igen med --default-character-set=utf8 och nu fungerar importen också från kommandoraden.
Kommandoraden jag har är:
mysql -u <username> -pac1 <password> --default-character-set=utf8 <schema> < <dumpfile>