Jag stod inför samma problem. Det visar sig att systemet inte kan komma åt hibernate-configuration-3.0.dtd från den angivna webbadressen.
<DOCTYPE hibernate-configuration PUBLIC
"-//Hibernate/Hibernate Configuration DTD 3.0//EN"
"http://www.hibernate.org/dtd/hibernate-configuration-3.0.dtd">
Så jag refererade till det från det lokala systemet.
<!DOCTYPE hibernate-configuration SYSTEM
"classpath://org/hibernate/hibernate-configuration-3.0.dtd">
Fungerade bra för mig. Hoppas det hjälper!