Föräldrar är poster utan parent_id .
Barn har parent_id lika med den överordnade kommentarens id .
SELECT ...
FROM comments AS parent
LEFT JOIN comments AS child
ON child.parent_id = parent.id
WHERE parent.parent_id IS NULL
ORDER BY parent.id, child.id;
Observera att självanslutningen bör vara en yttre sammanfogning så att du inte missar föräldrakommentarer utan barn.