Se det här svaret
. Det verkar som att MySQL-drivrutinen ska vara i {$TOMCAT]/lib delas mellan applikationer. Kontrollera att du inte inkluderar det med varje ansökan. Det fungerade åtminstone för mig och jag har kunnat ta bort varningen.
Om du använder Maven, markera beroendet som tillhandahållet.
UPPDATERING:
grundorsaken är att Tomcat har problem med att sopsamla drivrutinen eftersom den är registrerad i en gemensam enhet för flera applikationer. Att stänga ett program tillåter inte Tomcat att släppa drivrutinen. Se detta svar
.