Försök med detta. Du kan mata in datum i formatet dd/mm/åååå som i din fråga...
SELECT * FROM activity_emp
WHERE STR_TO_DATE(server_date_time, '%d/%m/%Y')
BETWEEN STR_TO_DATE('29/08/2012', '%d/%m/%Y')
AND STR_TO_DATE('07/10/2012', '%d/%m/%Y')
Uppdatering: Jag rekommenderar starkt att du ändrar datatyp från VARCHAR
till DATETIME
Skål!!!