Användningen av ~ föreslår att du använder Postgres. Om så är fallet gör de två frågorna väldigt olika saker. I Postgres inkluderar du inte tabellen som uppdateras i from klausul.
Så jag tror att du vill:
update fromemailaddress
set call = true
from email
where email.fromemailaddress = fromemailaddress.fromemailaddress and
LOWER(email.subject) ~ 'tester';
Din version uppdaterar alla rader i fromemailaddress eftersom det inte finns något villkor som ansluter fromemailaddress i update klausul och fea i from klausul.
Notera också:left join är onödigt eftersom where klausul förvandlar den till en inre koppling ändå.