Jag hittade äntligen svaret med hjälp av min kollega. Det verkar som att liquibase inte känner till sådana typer, så vi måste ändra sql-frågan manuellt:
<createTable tableName="t_name">
...
<column name="doubleArray" type="DOUBLE_ARRAY"/>
...
</createTable>
<modifySql dbms="postgresql">
<replace replace="DOUBLE_ARRAY" with="double precision[][]"/>
</modifySql>