Tillvägagångssättet med jsonb_array_elements
och jsonb_set
var rätt idé, men på något sätt kapslade du dem åt fel håll:
UPDATE myTable SET myColumn = jsonb_set(myColumn, '{A}', (
SELECT jsonb_agg( element || '{"myArray":[]}' )
FROM jsonb_array_elements(myColumn -> 'A') element
));
Btw om din kolumn redan har jsonb
datatyp, bör du inte behöva några casts.